Meskipun sudah satu tahun sejak Klub Renang SMA Iwatobi didirikan, belum ada anggota baru yang bergabung dengan klub ini. Sekarang Haruka Nanase dan Makoto Tachibana adalah siswa senior, bersama dengan teman-teman mereka yang lebih muda, Nagisa Hazuki dan Rei Ryuugazaki, mereka harus menemukan cara untuk menarik anggota baru. Jika tidak, klub ini akan terpaksa ditutup pada tahun berikutnya karena kurangnya anggota.
Sementara itu, dengan kelulusan yang akan datang, ini juga merupakan waktu bagi para senior untuk memutuskan rencana mereka untuk masa depan. Tidak seperti teman mereka Rin Matsuoka, kapten baru Klub Renang Akademi Samezuka yang bertekad untuk mewujudkan mimpinya menjadi perenang profesional, Haruka dan Makoto tidak yakin dengan jalur karier yang ingin mereka ambil.
Masalah lebih lanjut muncul ketika seorang teman lama Rin, Sousuke Yamazaki, datang ke kota untuk belajar di Akademi Samezuka; kedatangan perenang yang baru saja dibina ini menyebabkan ketegangan dalam hubungan di antara dia, Rin, dan Haruka.
