Kehidupan Koushi Nagumo yang berusia dua belas tahun tiba-tiba menurun ketika ayahnya meninggalkannya setelah rumah mereka terbakar. Ditinggal sendirian, Koushi pingsan di jalan, tetapi seorang wanita eksentrik bernama Mineru Wachi merasa iba dan membawanya ke asrama wanita "Megami-ryou".Setelah mengetahui keadaan Koushi, Mineru yang kebetulan adalah manajer sementara mengajaknya untuk menjadi ibu asrama resmi Megami-ryou. Namun, yang menunggunya adalah para penghuni asrama-masing-masing dengan tingkah anehnya sendiri-seperti Atena Saotome yang androfobik namun lembut, Kiriya Senshou yang tomboi dan feminin, dan Mineru sendiri, yang kecerobohannya tidak mengenal batas dalam hal sains. Meskipun demikian, Koushi melakukan yang terbaik untuk memenuhi tugas-tugas dalam kehidupan baru yang gila ini!
