Kisah film ini dimulai ketika Arata secara tidak sengaja menyentuh "Hermes Apocrypha," Grimoire milik Lilith. Tiba-tiba, dia diselimuti oleh cahaya putih terang, dan seorang gadis muncul di hadapannya. Dia menyebut dirinya Lilim, dan memperlakukan Arata dan Lilith sebagai orang tuanya. Pada saat yang sama dia muncul, sesuatu berubah di dunia. Perpustakaan Abadi yang terlarang terbangun. Di dalam Perpustakaan tersebut tersimpan puncak tertinggi dari Alkimia, Raja Iblis Putih. Penguasa Iblis Putih berencana untuk melenyapkan Arata dan Trinitas Tujuh untuk merebut posisi Penguasa Iblis. Dengan kekuatan yang tak terkira, Raja Iblis Putih menyerang Arata, dan memicu krisis putus asa di mana Arata dan Trinity Seven harus menyelamatkan dunia dalam pertempuran terakhir ini.
